1階がカフェ、2・3階が住居の物件を建てたい

40坪の土地に、仮にワンフロア20坪の建物を建てるとして、三階建てですと60坪になり、
建物だけで税抜き、5000-6000万程度になると思います。
参考にされてください。

大体の建てたい規模がないと正直言って難しいです。少なくてもご家族の構成でもあれば予測できますが？

こじんまり…がどの程度か、何人位が住む家なのか、などで規模は相当変わってくると思いますが、４人家族が普通に住める程度とすれば、ミニマム40坪（店舗10坪、住宅30坪程度）は必要になりそうですね。その規模なら、3000万円台後半〜4500万円程度かと思います。
基本的には規模で決まってくると思うので、もっと小さくて良ければその分費用もかからずにすみます。
参考になれば幸いです。

どの程度の大きさを求めているのか？など…具体的なことを書くと、きっともう少し具体的な回答が得られると思います。一般回答になってしまいますが、こじんまりなことを踏まえて店舗10坪、住居30坪の合計40坪で3500〜4500万円ぐらいが一般的ではないでしょうか。ただし、かなり細かな希望を聞いて具現化していくなかで超ローコストも豪華仕様もお施主さん次第です。デワデワ。

規模やグレード感にもよりますが、40〜50坪ぐらいの規模であれば、木造：80〜100万円（税抜）、鉄骨造：90〜110万円（税抜）、鉄筋コンクリート造（RC造）100〜120万円（税抜）ほどの建築費用になります。
その他、設計監理料、確認申請手数料などなど費用が加算されます。
ざっくり目安になれば幸いです。

当社ホームページをご覧の上、お気軽にご相談頂ければと思います。
https://kataoka-arch.com/

他の方も回答されている様に、規模や仕様によって異なってきますが概ね木造で建築工事費が80万〜100万円/坪(税別)程度になってくるかと思います。その他に設計料、外構工事などが別途かかります。
設計の際には費用をかけてでもどこに拘るのか、またどこを抑えていくのか予算を踏まえてじっくり話し合いながら進めていきます。
詳細をお聞きできますとより具体的なお話ができると思います。
また、私は滋賀県出身で滋賀県の設計事例もいくつかありますのでホームページも併せてご覧いただけますと幸いです。
ぜひお気軽にご連絡ください。

佐久間と申します。駐車スペースとはご家族用でしょうか？３階建とのことですが、プランの作り方でうまく２階建に抑えることができれば、3500万前後ではないかと思いました。

momomoさま

建物本体で床面積一坪（畳2枚分、約3.3㎡）あたり80から100万円程度、
駐車場のコンクリート敷や簡単な外構費用として100万円程度、
設計料やその他の手続の費用として300~400万円程度とお考えいただければ
（土地の環境や地盤の強さなどが影響することはありますが）
現実的です。

3階建てではなく2階建てのプランにできれば、3階建てよりも建設コスト、メンテナンスコストも抑えられるでしょう。土地が40坪あれば2階建ても十分可能性があるように思います。

店舗の内装・什器・サインといったトータルデザイン、
土地探しからのお手伝いもできますのでお気軽にお問い合わせください。